R para preparación y visualización de datos

Doctorado en Neurociencia Social y Cognición, UAI

Author

Gorka Navarrete

Published

September 12, 2024

Introducción

El objetivo de este seminario es aprender a usar R para preparar y visualizar datos, además de generar reportes reproducibles. Está pensado para alumnos de postgrado con conocimientos básicos de programación.

También conoceremos jsPsychR, un conjunto de herramientas creado por miembros del CSCN para ayudar a crear paradigmas experimentales con jsPsych, simular participantes, y estandarizar el proceso de preparación y análisis de datos.

R es un lenguaje de programación abierto, con una gran comunidad, orientado al trabajo, visualización y modelado de datos en contextos científicos y técnicos. Nos introduciremos de manera práctica a R, resolviendo problemas que encontramos habitualmente durante el quehacer científico, focalizándonos en el trabajo abierto, colaborativo y reproducible.

Objetivos

Dar las herramientas básicas a los alumnos para que puedan trabajar de manera autónoma con R y RStudio para el proceso de importación, transformación, visualización y reporte de datos.

Al finalizar el curso deberíamos ser capaces de:

  • Importar archivos de datos, transformar los datos, crear nuevas variables.
  • Realizar análisis de datos exploratorios, visualizar distribuciones y comparar grupos.
  • Generar reportes reproducibles con Quarto/RMarkdown
  • Crear paradigmas experimentales y un pipeline completo para la preparación de datos con jsPsychR.

Como empezar

Si ya has completado los pasos A-B-C y otras dependencias a instalar indicados en preparando nuestro sistema, puedes lanzar el siguiente código en tu ordenador para descargar los materiales del curso:

if (!require('usethis')) install.packages('usethis'); library('usethis')
usethis::use_course("gorkang/R_preparacion_visualizacion_datos")

Sigue las instrucciones que aparecen en la Consola para tener un nuevo proyecto de RStudio con todos los materiales del curso. El código anterior creará una carpeta llamada R_preparacion_visualizacion_datos-master.

La carpeta R_preparacion_visualizacion_datos-master contiene varias cosas. Las mas importantes son:

  • R_preparacion_visualizacion_datos.Rproj: para abrir el proyecto de RStudio del curso. Ábrelo siempre usando este archivo.

  • Carpeta docs: puedes abrir docs/index.html en tu navegador para ver el “libro” de este curso. Alternativamente, puedes consultar una version online del libro

  • Carpeta qmd: En esa carpeta esta el código fuente de los capítulos del libro

  • Carpeta data: Cuando usemos archivos de datos, vendrán de aquí

¡No hagas click sin antes haber intentado resolver el ejercicio sin ayuda!

Bibliografía

Bryan, J., & Hester, J. What They Forgot to Teach You About R. https://whattheyforgot.org/

Wickham, H., & Grolemund, G. (2016). R for data science: import, tidy, transform, visualize, and model data. O’Reilly Media, Inc. https://r4ds.had.co.nz/

Wickham, H. (2014). Advanced r. Chapman and Hall/CRC. https://adv-r.hadley.nz/

Xie, Y., Allaire, J. J., & Grolemund, G. (2018). R Markdown: The Definitive Guide. CRC Press. https://bookdown.org/yihui/rmarkdown/

Yihui Xie (2018). bookdown: Authoring Books and Technical Documents with R Markdown https://bookdown.org/yihui/bookdown/markdown-syntax.html