19 TODO

19.1 Urgent stuff

  • Review Shaded geom area BUG and move to the end of Visualize data
  • Replace setwd() part with create RStudio projects (leave setwd as legacy…)

19.2 Important

  • Name all the R chunks
  • use “, cache=TRUE” in time-consuming chunks
  • Complete most commonly used analysis
  • ANOVA with afex!
  • Reorganize a bit the sections/files.
  • Include info about cheatsheets!

19.3 Various

  • Long to wide in a between participants experiment.

19.4 INDEX PROPOSAL

# # Before we start
# 
# ## Installing R & R Studio
# ## R Basics
# * Instalacion de paquetes
# * Cargar paquetes
# 
# # Preparacion de datos
# ## Importar datos
# * CSV, XLS, SPSS (usar tibble?)
# 
# ## Ver datos
# * Columnas / filas - head() o tibble!
# * Tipos de variables (tibble)
# * Summary - incluyendo NAs, etc.
# 
# ## Preprocesamiento basico
# * Cambiar nombres variables
# * Cambiar tipos de variable
# * Filtrar valores
# * Filtrar NAs
# * Recodificar variables
# * Deteccion outliers
# * Filtrado a partir de RT (avanzado?)
# 
# ## Preprocesamiento avanzado y Construccion de variables
# * Manipulacion datos - wide to long
# * tydr y dplyr et al.
# * Confiabilidad
#     + Alpha
#     + Omega
# * Creacion variables
# * Filtrado variables
# * Sumas, promedios...
# * Segmentacion/categorizacion a partir de criterios logicos (si x>5 entonces A, else B)
# 
# # Analisis descriptivo y visualizacion
# 
# ## Variables individuales
# * Ver (## Visualizar datos) frecuencias, etc.
# * Histogramas, etc
# 
# ## Relacion entre variables - tablas
# * USAR tabla como en inferenciales y visualizacion...
# * En funcion de tipo de variables, usamos unas u otras tablas
# 
# ## Relacion entre variables - VISUALIZACIONES
# * USAR tabla como en inferenciales y visualizacion...
# * En funcion de tipo de variables, usamos unas u otras visualizaciones
# 
# 
# # Analisis inferenciales
# 
# * (APARTADOS)
#     + Assumptions
#         - Normalidad
#         - Independencia error
#         - Homocedasticidad
#     + Potencia
#     + Tamaño efecto
#     + Interpretacion resultados
#     + Como reportar resultados
# 
# ## Normalidad
# 
# ## t's
# * Pareadas
# * Independientes
# * 1 muestra
# 
# ## ANOVA
# * ANOVA simple
# * ANOVA factorial
# * ANOVA medidas repetidas
# * Modelos mixtos
# * ANCOVA
# 
# ## Correlacion y regresion
# * Correlacion pearson (continuas)
# * Correlacion spearman (ordinales o dist no parametricas)
# * Correlacion parcial / semiparcial
# * Correlacion items dicotomicos (?)
# * Regresion multiple
#     + Construccion variables dummy
#     + Analisis de residuos
#     + Efectos palanca y outliers
#     + Beta estandarizada / no estandarizada
#     + Interaccion
#     + Multicolinealidad
# 
# * Regresion logistica
#     + Binaria
#     + Multinomial
# 
# * Chi2!
# * test de Asociacion
# 
# ## Estadistica multivariada
# * Analisis discriminante
# * Analisis de conglomerados
# * MANOVA
# 
# # Analisis avanzados
# 
# ## Analisis de variables latentes
# * SEM
#     + Analisis de invariancia
# * Path analysis
# * Mediacion / Moderacion
# * Analisis factorial exploratorio
# * Analisis factorial confirmatorio
# * Analisis componentes principales
# 
# ## IRT Analisis respuesta al item
# 
# ## Multinivel - Modelos anidados/jerarquicos

19.5 Style guide

19.5.1 Sections

Each type of page should have a common layout. Please, do your best to keep a common and clean structure.

  • Remember to separate sections (H1?) using ***

19.5.1.1 Inferential analysis

  • Libraries
  • Import data
  • Prepare data
  • Code
    • Frequentist
    • Bayesian
  • Results report
    • Frequentist
    • Bayesian

19.5.1.2 Data visualization

  • Libraries
  • Data
  • Code

19.5.2 General

  • Spell check!

19.6 NOTAS - REMEMBER

19.6.1 REFS

https://sites.google.com/site/ullrtoolbox/home * Gorka:JA Toolbox EEG/ERP R???

19.6.2 NOTAS

  • Ejemplo con datos de EEG
  • Ejemplo con experimento medidas repetidas
  • Ejemplo con dif bases de datos